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Os fixadores coagulantes, como o álcool, e aqueles de ligação cruzada, como o formaldeído, podem causar alterações na configuração de proteínas, mascarando os determinantes antigênicos e, consequentemente, afetando a ligação do anticorpo.
A preparação tecidual consiste, sequencialmente, em fixação, desidratação e inclusão em parafina.
De um modo geral, a imunomarcação é somente de intensidade forte a muito forte.
Deve-se incluir controles positivos e negativos em cada reação imuno-histoquímica.
A parafina utilizada no processamento tecidual não deve exceder 60°C.