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Dados vetoriais e matriciais não podem ser integrados em um único ambiente SIG, uma vez que são estruturas de dados fundamentalmente distintas e incompatíveis entre si.
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No modelo raster, a precisão posicional das feições é limitada pelo tamanho da célula, sendo impossível representar com exatidão objetos menores que o pixel, ainda que sejam detectáveis espectralmente.
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Em um SIG, a base cartográfica vetorial é representada por meio de elementos gráficos contínuos, o que a torna mais adequada para representar superfícies com variação gradual, como altimetria e temperatura.
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Em um SIG, feições vetoriais do tipo ponto não possuem extensão espacial, sendo representadas unicamente por suas coordenadas geográficas ou projetadas.
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O SIG é um sistema computacional capaz apenas de armazenar dados geográficos, de modo que faz-se necessário o uso de softwares estatísticos externos para realizar análises espaciais complexas.