No método de Gram são utilizados os corantes Cristal de violeta, Lugol e Fucsina diluída.

No método de Gram os organismos gram-positivos fixam a fucsina e por isso se apresentam na cor roxo-escura.

No método de Gram os organismos gram-negativos retêm o complexo cristal violeta-lugol e por isso se apresentam na cor vermelha.

A última etapa da coloração de Ziehl-Neelsen é cobrir a superfície da lâmina com a solução de carbolfucsina (fucsina fenicada).

Na coloração de Ziehl-Neelsen, após descorar o esfregaço com solução de álcool – ácido a 3%, não se deve lavar a lâmina antes da adição do corante de contraste (azul de metileno).