Na fase remissiva, os exercícios ativos serão mais intensos, mas sempre intercalados por pausas de recuperação, de modo que não ocorra a fadiga nem o aumento da temperatura corpórea, sendo estes fatores que colaboram para o aparecimento de novos surtos.

Na fase aguda da doença, os exercícios deverão ser mais passivos, as pausas de recuperação mais longas, com exercícios para manter as amplitudes de movimento e evitar complicações secundárias, como as respiratórias, conforme a evolução.

Para manejar a espasticidade e manter a mobilidade articular, o fisioterapeuta deverá considerar a dominância de reflexos, hipotonicidade e movimentos normais. A utilização de gelo (crioterapia) é eficaz para reduzir a espasticidade, pois diminui diretamente o disparo dos fusos musculares e retarda ou bloqueia a condução dos impulsos nos nervos e músculos.

Para avaliar a incapacidade neurológica do paciente com esclerose múltipla, a escala mais utilizada é a escala do estado de incapacidade de Kurtzke, escala expandida do estado de disfunção (EDSS).