Para o fortalecimento da Fisioterapia inserida na PBE, os resultados das pesquisas clínicas de qualidade devem ser aplicados de forma cartesiana e pragmática, visto que as evidências geradas guiam o profissional em suas decisões clínicas com amplos benefícios, incluindo a redução de danos ao paciente. Assim, a PBE deve se guiar por publicações robustas, sempre no intuito de evitar que a experiência e a vontade do paciente sejam consideradas, ou seja, se embasando no que de fato importa que são as evidências cientificas para o sucesso ao tratamento.

Alguns fisioterapeutas experientes, com anos de profissão, utilizam-se de sua experiência clínica/profissional para a tomada de decisão dentro da PBE. No entanto, a experiência do profissional não é importante para situações de tomada de decisão. A utilização da experiência clínica/profissional deve ser excluída dentro do conceito da Prática Baseada em Evidência, visto que para que a fisioterapia baseada em evidências de fato ocorra deve estar presente exclusivamente a utilização da evidência de alta qualidade. 

Na Prática Baseada em Evidência, o profissional fisioterapeuta não julga a aplicabilidade da evidência diante de uma determinada situação, visto que não cabe a ele a ponderação da relação risco-benefício a partir da sua aplicação, da mesma forma que não cabe a ele que selecione os pacientes que potencialmente serão beneficiados com determinadas intervenções. A função do fisioterapeuta que se baseia na PBE é implementar a recomendação dada de acordo com as evidências disponíveis, excluindo o julgamento crítico e a individualização sobre a aplicabilidade da conduta a ser aplicada no paciente. 

A Prática Baseada em Evidência é um modelo de tomada de decisão clínica que integra de forma equilibrada as melhores evidências científicas disponíveis, a experiência do profissional de saúde e as preferências, valores e contexto do paciente, assim como as características particulares dos pacientes (biológicas e escolhas), recursos disponíveis e circunstâncias. O objetivo é garantir que as condutas adotadas sejam fundamentadas no melhor e mais atualizado conhecimento científico, e também adaptadas às necessidades individuais de cada pessoa, promovendo cuidados mais seguros, eficazes e centrados no paciente. 

Para que a fisioterapia baseada em evidências de fato ocorra, o profissional fisioterapeuta deve sempre selecionar os Ensaios Clínicos Randomizados (ECR), pois são a única forma válida de pesquisa científica. Na PBE, o sucesso terapêutico depende da análise crítica de estudos de alto nível científico, considerados exclusivamente os ECR, desconsiderando a opinião do fisioterapeuta e as preferências do paciente.