A febre amarela é uma doença causada por um flavivírus, considerada uma arbovirose. O gênero Cebus é muito sensível ao vírus e apresenta taxa de letalidade elevada, porém os gêneros Alouatta, Callithrix e Ateles, apesar de infectarem-se facilmente, apresentam baixa taxa de letalidade e geralmente desenvolvem imunidade.

Os cebídeos e atelídeos necessitam de dieta variada e rica quanto à parte proteica, enquanto para os calitriquídeos, por ocuparem vários nichos dentro da floresta, principalmente os estratos superiores, podem comer uma grande variedade de formas vegetais maduras e jovens. Ateles é considerado um folívoro, mas em certos períodos do ano é basicamente frugívoro, quase o oposto dos primatas do gênero Alouatta.

A infecção por Toxoplasma gondii na maioria dos animais e humanos adultos imunocompetentes é assintomática em razão da efetiva proteção imunológica que envolve anticorpos que agem extracelularmente e fatores decorrentes da imunidade celular. Nas infecções em que a imunidade não é adequada, os taquizoítas continuam a se multiplicar destruindo um número excessivo de células e produzindo lesões em múltiplos órgãos, sendo que pneumonia, hepatite e encefalite são as principais causas da doença e morte. 

Ao contrário dos saguis, o restante dos gêneros de primatas não humanos é altamente suscetível ao Human herpesvirus 1, desenvolvendo doença sistêmica e fatal. Geralmente, todos os animais de um grupo desenvolveram rapidamente a doença, sugerindo assim uma transmissão de macaco para macaco. O curso clínico da infecção é agudo. Os achados clínicos mais frequentes são prostração, hiporexia e convulsões.