A digestão de proteínas tem início no estômago com a ação da pepsinogênio, ativado pelo ácido clorídrico em pepsin. Essa enzima inicia a quebra das proteínas em peptídeos. No intestino delgado, a enteroquinase ativa o tripsinogênio em tripsina, que por sua vez ativa outras enzimas proteolíticas pancreáticas. A fase final da digestão proteica ocorre na borda em escova, onde os peptídeos são hidrolizados em aminoácidos ou pequenos peptídeos, que são então absorvidos e transportados ao fígado.