A Farmácia Hospitalar necessita atender de maneira integral as necessidades do hospital e para isso alguns ambientes são necessários. Segundo a publicação “Padrões mínimos para Farmácia Hospitalar e Serviços de Saúde” da Sociedade Brasileira de Farmácia Hospitalar (1997),  para o funcionamento de uma unidade de Farmácia Hospitalar devem existir,  no mínimo,  os seguintes ambientes: