Era uma cidade densamente povoada em tempos pré-históricos, dotada de um sistema de escrita, uma organização econômica baseada na criação de gado e dotada de fortes estruturas defensivas, tudo isso antes da chegada dos europeus.

Os grandes painéis de pinturas da Pedra Pintada indicam que o local era provavelmente um centro cerimonial, frequentado por povos ameríndios muitos séculos antes da chegada dos europeus.

É um dos muitos sítios arqueológicos situados na região de savana (lavrado) em Roraima, com artefatos e características que salientam fortes afinidades culturais e trocas com os povos antigos da região das Guianas e da Venezuela.

As grandes formações graníticas da Pedra Pintada e arredores, conhecidas como inselbergs, são de origem natural, resultantes de vulcanismos e/ou plutonismos muito antigos, enquanto seu formato arredondado se deve ao intemperismo, ou seja, às forças naturais de erosão que provocam o desgaste em camadas.

O sítio da Pedra Pintada foi habitado há pelo menos quatro mil anos por grupos caçadores-coletores-pescadores, que depois introduziram a cerâmica e praticaram a horticultura e agricultura incipiente; diferentes grupos humanos povoaram a região em épocas posteriores, até a chegada dos europeus.