Durante uma investigação de surtos e epidemias, é possível utilizar a epidemiologia analítica quando há várias exposições envolvidas e a causa não é clara. Por esse método, testamos as hipóteses comparando grupos de doentes e não doentes que se expuseram ou não a cada um dos fatores suspeitos. Nesse caso, o estudo mais utilizado em investigações de surtos de doenças transmissíveis denomina-se