A coloração de Gram é uma metodologia morfotintoríal complexa e de alto custo.

A sequência correta das substâncias utilizadas na coloração de Gram segue a seguinte ordem: adição de cristal violeta-álcool-lugol-safranina.

A coloração de Gram baseia-se na capacidade de alguns microrganismos reterem o cristal violeta no núcleo da célula bacteriana.

A coloração de Ziehl-Neelsen é utilizada quando há suspeita de bacilos álcool-ácido resistentes, como Mycobacterlum tuberculosis.

A diferença básica entre a coloração de Ziehl Neelsen e a de Gram é que está última necessita de uma etapa de aquecimento com emissão de vapores.