Na maioria dos casos, a ausência do baço (asplenia) acompanha o isomerismo atrial esquerdo, enquanto que múltiplos baços são encontrados em pacientes com isomerismo direito.

Em corações onde um ventrículo é dominante, o ventrículo rudimentar pode variar sua posição, mas quase sempre ventrículos direitos rudimentares são encontrados póstero-inferiormente, enquanto que ventrículos esquerdos rudimentares ocupam uma posição ântero-superior na massa ventricular.

Quando existe conexão atrioventricular ambígua, a estrutura tridimensional, ou topologia, da massa ventricular deverá ser descrita como: direita ou esquerda. Tal padrão pode ser determinado imaginando-se a palma de uma mão colocada sobre a superfície septal do ventrículo morfologicamente esquerdo.

A forma pela qual os troncos arteriais estão conectados à massa ventricular deve ser analisada separadamente da morfologia das valvas arteriais. Quando há dois troncos arteriais presentes, eles podem estar conectados à massa ventricular de forma concordante ou discordante ou indeterminada.

Quando apenas um tronco arterial está conectado à massa arterial, então existe via de saída única do coração. Tal via de saída única dá-se usualmente através de um tronco comum guarnecido por uma valva arterial comum. Pode ainda se dar através de um tronco solitário, ou mesmo através de uma aorta ou tronco pulmonar, quando é impossível localizar a origem do outro tronco, atrésico.