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O hipogonadismo hipogonadotrófico pode ser proveniente de distúrbios do hipotálamo, como, por exemplo, síndrome de Kallman, distúrbios funcionais e destruição anatômica.
Não havendo útero, a ausência de telarca e pubarca sugere diagnóstico de síndrome da insensibilidade total aos androgênios.
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A preservação do máximo de tecido ovariano permite zelar não só por uma melhor reserva ovariana, mas também pela produção de androgênios: os ovários são responsáveis diretos por aproximadamente 25% da testosterona circulante e, de maneira indireta, por mais 25% de testosterona provinda da conversão periférica da androstenediona ovariana em testosterona.
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As suprarrenais são responsáveis por 90% da produção de SDHEA (sulfato de desidroepiandrosterona) e 90% de DHEA (desidroepiandrosterona), enquanto os ovários respondem por 10% do DHEA na circulação sanguínea.
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A doença inflamatória pélvica e a endometriose compreendem as duas causas mais comuns de infertilidade, devendo ambas ser investigadas e, se necessário, tratadas nesse caso.