A bacia do Rio Jequitinhonha está limitada ao sul pela bacia do Rio Pardo, a oeste pela Serra do Espinhaço, e ao norte por uma cadeia de Serras. Atualmente, os principais usos das águas na bacia são para a indústria, a mineração e a irrigação. A bacia do Rio São Francisco abrange oito estados: Bahia, Minas Gerais, Pernambuco, Alagoas, Sergipe, Goiás, Distrito Federal e São Paulo e a sua precipitação média anual na região hídrica de São Francisco é muito abaixo da média nacional.

O potencial hidrelétrico da bacia do Rio Jequitinhonha já foi estimado, estando efetivamente implantadas apenas as Usina Hidrelétrica de Irapé, Salto da Divisa e Três Marias. A existência de projetos hidrelétricos restringe a utilização dos deflúvios existentes para outros usos nas bacias. Na bacia do Rio São Francisco, os principais temas para a gestão das águas são: os eventos críticos de chuva, o abastecimento urbano, a qualidade da água, a irrigação, o potencial industrial e a navegação.

O potencial hidrelétrico da bacia do Rio Jequitinhonha ainda não foi calculado, estando efetivamente implantadas apenas as UHE de Irapé e de Salto da Divisa no rio Jequitinhonha. A bacia do Rio São Francisco abrange sete estados: Bahia, Minas Gerais, Pernambuco, Alagoas, Sergipe, Goiás e Distrito Federal e a sua média anual é muito abaixo da média nacional, apresentando frequentes situações de escassez de água. Apesar disso, tem importante papel na geração de energia para a região sudeste do país.

A principal nascente da bacia do rio Jequitinhonha nasce a uma altitude acima dos 12.000 metros e está limitada ao norte pela bacia do rio Pardo, a oeste pela Serra do Espinhaço, e ao sul por uma cadeia de Serras. Na bacia do Rio São Francisco, a precipitação média anual é muito abaixo da média nacional, apresentando frequentes situações de escassez de água. Devido a isso, na geração de energia para a região nordeste do país, tem sido substituída pela produção fotovoltaica.

A rede de distribuição de energia da bacia do Rio Jequitinhonha depende das subestações fora da região e das linhas de transmissão de média e baixa tensão pelo que não suporta novos projetos de irrigação, fato limitador ao uso do potencial da agricultura irrigada. Na bacia do Rio São Francisco, os principais temas para a gestão das águas são: os eventos críticos de seca, o abastecimento urbano, a qualidade da água, a irrigação, o potencial hidroenergético e a navegação.