O Projeto Pedagógico de Curso (PPC) é constituído, dentre outros, pelos seguintes componentes: matriz curricular, com a carga mínima de 360 (trezentos e sessenta) horas, contendo disciplinas ou atividades de aprendizagem, com o respectivo plano de curso, que contenha objetivos, programa, metodologias de ensino-aprendizagem, previsão de trabalhos discentes, avaliação e bibliografia. 

É uma modalidade de formação pós-graduada stricto sensu em que o trabalho de conclusão final do curso poderá ser apresentado em diferentes formatos, tais como dissertação, revisão sistemática e aprofundada da literatura, artigo, patente, registros de propriedade intelectual, projetos técnicos, publicações tecnológicas; desenvolvimento de aplicativos, de materiais didáticos e instrucionais e de produtos, processos e técnicas; dentre outros, de acordo com a natureza da área e a finalidade do curso, desde que previamente propostos e aprovados pelo órgão competente. 

Diferentemente dos doutorados profissionais, os mestrados profissionais só podem ser ofertados na modalidade a distância, observado o limite de 40% previsto na legislação específica dessa modalidade.

O corpo docente dos mestrados profissionais deverá ser composto por docentes permanentes, excluindo outras categorias, como professores com experiência profissional acadêmica e não acadêmica técnica, científica, de inovação e de orientação ou supervisão na área proposta. 

 Diferentemente dos mestrados acadêmicos, a regulação das propostas de cursos novos de pós-graduação stricto sensu na modalidade profissional, em nível de mestrado, além da avaliação dos cursos oferecidos, é de responsabilidade do Conselho Nacional de Educação.