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A vulnerabilidade dos povos indígenas às infecções sexualmente transmissíveis tem-se intensificado, especialmente devido às relações dessas populações com a urbana, à frequência e permanência dos indígenas nas áreas urbanas e às invasões das terras indígenas, afetadas por projetos de exploração de recursos naturais.
Como parte da Política Nacional de Atenção à Saúde dos Povos Indígenas, foi criado o Sistema de Informação da Atenção à Saúde Indígena (SIASI) com vistas à coleta, processamento e análise de informações abrangendo óbitos, nascimentos, morbidade, imunização, produção de serviços, recursos humanos e infraestrutura para o acompanhamento da saúde das comunidades indígenas.
Atualmente, as mudanças intensas em sua relação com a terra, o trabalho, a urbanização e a incorporação de novos hábitos culturais fizeram que as doenças infecciosas tornassem as mais importantes nas populações indígenas.
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Segundo portaria do Ministério da Saúde, a execução das ações de vacinação nas áreas indígenas é de competência das secretarias municipais de saúde.
Os agentes indígenas de saúde, alicerces do modelo assistencial proposto pela Política Nacional de Saúde Indígena, constituem o elo fundamental entre o conhecimento tradicional e o sistema oficial de saúde com vistas à comunicação intercultural.