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A fim de compreender os mecanismos genéticos associados à altura e ao alongamento do caule em uma determinada população de Arabidopsis thaliana adaptada a temperaturas mais elevadas, pesquisadores estão estudando o papel do gene AtGA20ox1, utilizando o sistema CRISPR-Cas9. Durante o planejamento do desenho experimental, os pesquisadores observaram a necessidade da presença de uma pequena sequência adjacente ao alvo, denominada protospacer adjacent motif (PAM). No contexto do CRISPR-Cas9, assinale a alternativa correta sobre a sequência PAM.
Durante a clonagem molecular de um gene de interesse em Escherichia coli, uma pesquisadora preparou células competentes utilizando solução de cloreto de cálcio (CaCl₂) e realizou o processo de transformação por choque térmico, seguido de plaqueamento em meio LB contendo antibiótico. Após incubação, foram observadas colônias em crescimento apenas nas placas contendo o plasmídeo. Considerando os princípios físico-químicos e biológicos envolvidos nessa técnica, é correto afirmar que:
Sobre as tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS), analise as assertivas abaixo e assinale V, se verdadeiras, ou F, se falsas.

( ) As plataformas Illumina e Ion S5 são exemplos de sequenciamento de nova geração, mas se diferenciam no método de detecção da incorporação de nucleotídeos: a plataforma Illumina utiliza fluorescência e o Ion S5 utiliza mudanças de pH.

( ) O sequenciamento de long reads é ideal para a montagem de genomas de novo, pois a capacidade de ler fragmentos de dezenas a centenas de milhares de pares de bases ajuda a resolver regiões complexas e repetitivas.

( ) A reação em cadeia da polimerase é um passo obrigatório para todas as tecnologias de NGS, pois é a única maneira de amplificar o material genético e garantir que haja DNA suficiente para a análise.

( ) O demultiplexing é uma etapa da análise secundária, em que as leituras de cada amostra são separadas em arquivos individuais, o que é fundamental para a análise subsequente.

A ordem correta de preenchimento dos parênteses, de cima para baixo, é:
O preparo de bibliotecas genômicas é uma etapa fundamental para o sucesso do sequenciamento, seja ele voltado à análise genômica, transcriptômica ou metagenômica. Cada tipo de amostra requer protocolos específicos de fragmentação, purificação e ligação de adaptadores. A compreensão das diferenças entre esses procedimentos é essencial para interpretar os resultados de experimentos de RNA-seq, metagenômica e NGS em geral. Analise as assertivas abaixo sobre diferentes estratégias empregadas na construção de bibliotecas de DNA e RNA, assinalando V, se verdadeiras, ou F, se falsas.

( ) Na construção de bibliotecas metagenômicas, o DNA obtido de múltiplas espécies precisa ser fragmentado aleatoriamente.

( ) Durante o preparo de bibliotecas de cDNA para RNA-seq, a fragmentação enzimática permite o controle mais preciso do tamanho médio dos fragmentos.

( ) A vantagem de construir uma biblioteca de DNA de fita dupla garante a cobertura de DNA mitocondrial.

( ) Durante a conversão de RNA em cDNA, o uso de transcriptase reversa é fundamental para promover a ligação covalente entre adaptadores e RNA.

( ) Durante o preparo de bibliotecas de RNA-seq, o uso de oligo(dT) serve para selecionar RNA mensageiro por hibridização à cauda poli(A).


A ordem correta de preenchimento dos parênteses, de cima para baixo, é:
Em biologia molecular, protocolos clássicos de extração utilizando fenol-clorofórmio, a adição de acetato de sódio e etanol é uma etapa crítica após a separação de fases, e tem como principal função